通過對奶牛飼草、采食行為、反芻及糞便等觀察，就能對奶牛是否健康，是否正常生長、生產做出判定，問其原因，老師們給出簡單、明了的答復：看牛看兩頭，即看牛嘴，看牛糞。
一般糞便的顏色受飼料種類、膽汁濃度以及飼料和消化物的流通速率的影響。通常情況下，當奶牛采食青綠飼料時糞便顏色是深綠色；當采食干草時，糞便顏色將變深呈褐綠色；當采食大量谷物飼料時，糞便的顏色通常為黃綠色，這種顏色是由粗料和谷物的量及谷物加工過程的變化共同導致的。根據美國密歇根州大學提出的糞便分值體系（Manure scoring system）對糞便進行評分。奶牛糞便稠度的正常值為：干奶期為3.5，分娩前2-3周為3.0，分娩后2-3周為2.5，高產牛為3.0，泌乳后期為3.5。
當奶牛存在健康問題時，通過觀察糞便可以給我們提供飼養及治療線索。不同種類糞便的臨床表現如下：
(1)糞便中含有較多未消化精料顆粒的一過性腹瀉。這種腹瀉是奶牛飼養管理過程中較常見的一種腹瀉形式，常常由于一次喂給較多精料，或突然更換飼料，沒有過渡期或過度時間過短所致。這種腹瀉的特點是腹瀉物中含有多量未消化的精料顆粒，糞便帶有較強的酸臭味。出現這種情況時，一般經過短暫的禁食精料或適當增加過渡期的天數大多數便可恢復。
(2)糞便顏色黑、干燥。對成年牛來說，糞便干燥的直接原因是胃腸蠕動弛緩或麻痹，多由發燒所引起。如在口蹄疫、流行熱等熱性疾病的初期，有相當數量的患病牛糞便會呈現這種形態變化。
(3)膠胨樣糞便。糞便外裹有膠胨樣物質、質地粘稠。這是腸梗阻、腸套疊的典型表現。阻塞程度不同、膠胨樣物質中所含的糞便的多少也有差別，完全阻塞時只能排出少量膠胨樣物質，膠胨樣物質中幾乎不含糞便。腸阻塞多由飼料中的異物引起，慢性腸炎也可引起腸梗阻，胃腸扭轉可直接引起胃腸梗阻。嚴重的真胃左方變位也可引起奶牛不完全性腸梗阻，此時糞便中會出現一定數量的黏液，這是腸黏膜脫落的結果。阻塞程度更進一步時，少量糞便的外面可被膠胨樣黏液完全包裹，形成內有少量糞便外包膠胨樣黏液的球形糞便。
(4)水樣糞便，糞便中有未消化的較長草段，水草分離。這是因飼喂大量粗硬難消化飼料而導致的瘤胃積食在一定階段的糞便表現。這種糞便的特點是糞便水樣、水草分離、糞便中含有未消化的較長草段，糞便有惡臭味。瘤胃功能嚴重障礙是導致此表現的直接原因，飼草在瘤胃中異常發酵是導致此糞便形態特征的直接原因。
(5)稀面糊狀糞便。奶牛副結核病在持續性腹瀉階段會表現出這種糞便異常，這種糞便的特點是腹瀉量大，嚴重時呈噴射狀，腹瀉出的糞便質地均勻、細碎呈稀面糊狀。
(6)糞便中含有血液、黏液的水樣糞便。這種糞便是牛在患病狀態下較多見的一種糞便形態，多見于病毒性腹瀉、腸炎、食鹽中毒等疾病。
(7)含有鮮紅色血液、血塊的腹瀉糞便。此類糞便多見于奶牛冬痢和牛球蟲病。奶牛冬痢多發生于成年牛，而奶牛球蟲病多發生于2歲以內的牛。
(8)牛梭菌性腸炎糞便特征。糞便呈惡臭的黑色水樣，有一定黏度、并含有少量血液成分
(9)糞便干、少，呈球狀或餅狀。這種糞便形態較少見，是奶牛瓣胃阻塞的癥狀之一，色澤變化不大。
(10)犢牛排灰白、黃白色水樣或粥樣稀便，這是犢牛下痢的典型糞便，初期排灰白、黃白色水樣或粥樣稀便，有時糞中混有未消化的凝乳塊。后期糞便中含有粘液、血液、偽膜等，糞色由瓿色變為褐色或血樣，具有酸臭或惡臭氣味。尾根和肛門周圍被稀糞污染，尿量減少。病程后期牛常因脫水衰竭而死。這要與犢牛應消化不良排灰白、黃色軟便相區別，犢牛因吃奶過渡而排灰白色軟便，若吃料過渡則排黃色軟便，這在奶牛場也是普遍存在的現象。
總之，糞便作為奶牛從嘴里吃進飼草料，通過一系列的代謝，較終排出的廢氣物，它是評估奶牛瘤胃機能，瘤胃功能好壞以及奶牛消化或發酵位點和程度的較簡單的方法，也查明奶牛飼養與疾病臨床和亞臨床癥狀的一種較簡單的方法。